5月7日，*ST吉藥發布公告表示，公司5月4日接到深圳交易所《關于吉林制藥股份有限公司股票暫停上市的決定》。因公司2009年、2010年、2011年連續三年虧損，根據《深圳證券交易所股票上市規則》14.1.1條第一款的規定，深圳交易所決定公司股票自5月7日起暫停上市。
公告還表示，如果公司股票被暫停上市后，未能在法定期限內披露暫停上市后首個年度報告，或者披露的首個年度報告顯示公司出現虧損，公司將被深圳交易所終止股票上市。
截至目前，*ST吉藥成為2012年滬深兩市第一家被暫停上市的公司，同時也是滬深兩市退市制度征求意見稿公布以來第一家被暫停上市的公司。
今年1月20日，*ST吉藥發布2011年年度業績預告稱，預計該年度歸屬上市公司股東的凈利潤為230萬元左右，基本每股收益0.01元左右。
隨后的4月13日，*ST吉藥卻發布業績預告修正公告稱，會計師事務所對公司財務預審計后提出相關審計意見表示公司賬面三年以上庫齡的原材料、發出產成品計提減值準備482.42萬元，銷售提成費用383.85萬元，壞賬準備33.93萬元，故公司將2011年度業績預告修正為歸屬上市公司股東的凈利潤虧損556.03萬元，基本每股收益虧損0.035元。
在業績預告修正“扭贏為虧”后不久，4月26日，*ST吉藥公布2011年年度業績報告表示，公司歸屬上市公司股東的凈利潤虧損556.03萬元，較去年減少88.25%；2010年公司凈利潤虧損4733.91萬元，2009年公司凈利潤虧損1564.84萬元，至此，*ST吉藥連虧三年。
5月7日，在發布暫停上市消息的同時，*ST吉藥還公告稱，4月27日，公司被國家食品藥品監管局發現部分批次藥品所用藥用膠囊的鉻含量嚴重超出國家藥典標準規定。根據藥監部門的抽查結果，公司生產的小檗堿甲氧芐啶膠囊，批號為20110101，膠囊中鉻含量超過國家《2010版中國藥典》規定。
公告還表示，目前公司已初步查明2011年共銷售“毒膠囊”21900盒52.56萬粒，該膠囊全部來源于浙江省新昌縣誠欣膠囊有限公司。公司正積極組織召回不合格批次藥品，并申請食品藥品監管部門監督銷毀；此外，公司積極配合藥監部門，對膠囊劑現有庫存藥品就地封存，繼續認真配合監管部門進行深入的調查。
*ST吉藥稱，上述膠囊銷售收入44548.72元，銷售成本29527.77元，實現銷售毛利潤(銷售收入-銷售成本)15020.95元。本次膠囊生產線停產，相關膠囊產品被召回送檢對公司的營業收入及其他財務影響暫不能確定。
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